Базовое репродуктивное число вируса

В конце декабря 2019 года китайские власти сообщили о вспышке пневмонии неизвестного происхождения в городе Ухань. Возбудителем стал коронавирус 2019-nCoV. Он способен поражать дыхательную, пищеварительную и нервную системы как человека, так и животных. Из-за резкого роста заболеваемости китайские власти опасаются, что эпидемия может распространиться еще шире.

Специалисты ВОЗ считают, что не каждый человек с признаками простуды требует госпитализации. Только четверть инфицированных имеют тяжелое течение болезни.

Хоть прошло уже около месяца с начала эпидемии, о коронавирусе из Китая известно очень мало. До сих пор не ясно, насколько заразна инфекция. В эпидемиологии существует базовое репродуктивное число — Ro. Оно помогает определить, может ли болезнь распространиться среди населения и в каких масштабах. У гриппа показатель Ro около 1,2. У испанского гриппа — 2,8, а у кори — от 12 до 18. Новый китайский коронавирус имеет показатель 1,4 — то есть примерно в девять раз менее заразен, чем корь.

Однако исследователи из Имперского колледжа Лондона полагают, что каждый пациент заражает двух-трех других.

Вакцины от заболевания пока нет, хотя специалисты со всего мира, в том числе из России, работают над созданием лекарства. При этом у российского Минздрава появилось несколько идей по исцелению от заболевания.

По состоянию на 30 января, от коронавируса погибли 170 человек. Это число растет с каждым днем. Еще вчера, 29 января, жертв было 132. Число зараженных по всему миру — 7711 человек.

Цифры, конечно, большие. Особенно если учитывать, что с момента появления коронавируса прошло около месяца. Все познается в сравнении. По всему миру зафиксировали 7711 заболевших новым коронавирусом, а погибли от него 132. Это значит, что смертности от заразы — 1,71%. А какие показатели у других болезней?

Грипп

Грипп может протекать как в легкой, так и тяжелой форме, а иногда заканчиваться смертью. По оценками ВОЗ, ежегодные эпидемии гриппа приводят к трем-пяти миллионам случаев тяжелой болезни и к 290-650 тысячам случаев смерти от респираторных заболеваний. Получается, что смертность от гриппа составляет 13%.

По словам главного врача Городской инфекционной больницы имени С. П. Боткина Алексея Яковлева, в России от гриппа умирают 11 тысяч человек ежегодно.

Атипичная пневмония

Сначала новый вирус приняли за атипичную пневмонию, не понимая его происхождения. Так заболевание прозвали СМИ в далеком 2002 году — тогда в ноябре в китайской провинции Гуадун впервые зарегистрировали коронавирус SARS. За время своего существования зараза убила 813 человек из 8437 заболевших.

Снова считаем: процент смертности от атипичной пневмонии, судя по данным о заболевших и умерших, составил 9,64.


Источник фото: Pxhere

Корь

В 2017 году корь стала причиной смерти 110 тысяч человек, в основном детей до пяти лет. Это большая цифра, но она ничтожна по сравнению с той статистикой, которая наблюдалась в более ранние годы. Например, в 2000-м зафиксировали 545 тысяч случаев смерти от кори.

Корь — крайне заразная и тяжелая болезнь вирусного происхождения. До введения противокоревой вакцины в 1963 году крупные эпидемии происходили каждые два-три года. И каждые 12 месяцев умирали 2,6 миллиона человек.

К 2020 году врачи смогли снизить смертность от нее на 80%. В России заболеваемость корью в 2018 году составила 1,7 тысячи случаев на 100 тысяч человек.

Рак

Рак — одна из основных причин смерти в мире. В 2018 году от этого заболевания умерли 9,6 миллиона человек. Примерно каждая шестая смерть спровоцирована раком. Чаще всего смерть наступает от рака легких (1,76 миллиона случаев), толстой и прямой кишки (862 тысячи случаев), желудка (783 тысячи), печени (782 тысячи) и молочной железы (627 тысяч).

В 2017 году 24,5 миллиона человек заболели раком. Из них 9,6 миллиона умерли. Смертность от злокачественных опухолей достигла почти 40%.


Источник фото: Pxhere

СПИД

Синдром приобретенного иммунодефицита (СПИД) развивается при инфицировании вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ). Он поражает иммунную систему и ослабляет защиту организма от инфекций и болезней. ВИЧ может передаваться во время секса, переливания зараженной крови, использовании зараженных игл или острых инструментов.

В 2018 году насчитывалось около 37,9 миллиона ВИЧ-инфицированных, из которых умерли от 570 тысяч до миллиона человек. Если брать максимальное значение по смертям, то процент составляет 2,64.

В России первый случай заболевания выявили в 1987 году, а по состоянию на 30 июня 2019-го, зафиксированы 1,38 миллиона ВИЧ-инфицированных россиян. Из них умерли 335 867 человек, а это 24,34%.


Источник фото: Pxhere

Болезни сердца

Сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ) — это основная причина смертей во всем мире. Ни по какой другой причине ежегодно не умирает столько людей. ВОЗ считает, что от болезней сердца и инсульта в 2030 году умрут 23,6 миллиона человек по всему миру.

В 2016 году от ССЗ умерли 17,9 миллиона человек. Это 31% смертей в мире.


Проверки в Китае после вспышки эпидемии коронавируса / Источник: Newspix.pl / ABACA

  • Категория: Новости
  • ссылка

  • 250.000 человек заразятся коронавирусом уже в ближайшие 10 дней
  • Существует высокая вероятность того, что это на самом деле, – это слишком оптимистично

Ведущие ученые эпидемиологи из университета Ланкастера, Великобритания, сделали неутешительные прогнозы относительно того, как будет развиваться вспышка коронавируса 2019-nCoV. В только что опубликованном докладе говорится о том, что мир стоит на пороге глобальной эпидемии.

Ученые проанализировали доступные данные, касающиеся развития вспышки коронавируса, которая началась в конце января 2019 года в китайском городе Ухань, и пришли к выводу, что власти Китая имеет дело с вирусом, который способен распространяться гораздо быстрее, чем меры властей, по его сдерживанию. А это, в свою очередь, означает, что инфекция распространится от города к городу и от континента к континенту за считанные недели.

Базовое репродуктивное число коронавируса 2019-nCoV может достигать 4, что означает, что каждый заразившийся заразит еще четверых вокруг себя.

Согласно определению ученых Стэнфордского университета базовое репродуктивное число R0, определяется как ожидаемое количество вторичных случаев заражения, вызванное одной (типичной) инфекцией в полностью восприимчивой популяции. Важно отметить, что R0 — это безразмерное число, а не скорость, с временной единицей − 1, где τ – передаваемость (то есть вероятность заражения при контакте между восприимчивым и инфицированным человеком), ¯c – средняя скорость контакта между заражаемым и зараженным индивидом, а d – длительность периода инфицированности.

R0 ∝ (инфекция /контакт) х (контакт/время) х (время/инфекция)

Или R0 = τ · c¯ · d

А что на счет R 0 вируса 2019-nCoV, который уже (только по подтвержденным данным) уже унес жизни более сорока человек в Китае и которым (только по подтвержденным данным, реальное количество заболевших судя по всему гораздо больше) заразилось уже 1354 человека человек?

Как уже можно понять – не стоит принимать на веру официальные цифры. Ведь эпидемия началась в Китае, который, как известно, не является самой прозрачной страной в мире, особенно когда речь идет о вопросах, которые могут вызвать массовую панику и, как следствие, сомнение в эффективности руководящей роли партии и правительства.

Поэтому, лучшее, что нам остаётся, – это строить догадки, и именно это в четверг сделала ВОЗ (Всемирная организация здравоохранения), выступившая с заявлением, которое было посвящено эпидемии коронавируса. В заявлении, в частности, говорится:

Вирус передается от человека человеку, предварительная оценка R0 1,4-2,5 . . Сообщается, что из подтвержденных случаев 25% являются тяжелыми.

Излишне говорить, что, хотя, как говорят врачи-вирусологи, показатель сам по себе уже 2,5 довольно высок, и соответствует уровню эпидемии испанского гриппа, в ходе которой в 1918 году заразилось около полумиллиарда человек, в результате чего погибло от 50 до 70 миллионов человек, реальное число коронавируса R 0 может в конечном итоге гораздо выше.

Перед вами рабочая гипотеза Джонатана Рида, британского эксперта по биостатистике из Университета Ланкастера, Великобритания, который, вместе с четырьмя коллегами опубликовал статью, в которой оцениваются параметры R 0 для коронавируса из Ухани, и в которой говорится о том, что R 0 2019-nCoV будет между 3,6-4,0, и приходит к выводу о том, что распространение коронавируса вероятно примет масштабы глобальной пандемии.

Рид переводит свои слова на язык цифр и делает пугающее предсказание: уже через 9 дней, или к 4 февраля 2020 года, число инфицированных только в одном Ухане превысит 250 тысяч.


Скриншот диаграммы из статьи Джонатана Рида

Эпидемические прогнозы для (A) Ухань, (B) выбранных городов Китая и (C) выбранных стран. Предполагаемые выявленные случаи также нанесены на карту для Ухани.

Ожидается, что после Ухани городами, где неизбежны масштабные вспышки эпидемии в других районах Китая – станут Шанхай, Пекин, Гуанчжоу, Чунцин и Чэнду.


Скриншот диаграммы из статьи Джонатана Рида

Прогнозируемые масштабы эпидемии (число инфицированных в настоящее время людей) в отдельных городах 4 февраля 2020 года, при условии отсутствия изменений в передаваемости с текущего времени до 4 февраля.


Скриншот диаграммы из статьи Джонатана Рида

Связь Уханя с другими городами и провинциями материкового Китая на основе анализа трафика коммерческих авиакомпаний (данные за январь 2017 года).

Важно отметить, что модель Рида утверждает, что Пекин уже опоздал в своем ответе и что недавно введенные «ограничения на поездки в и из города Ухань вряд ли будут эффективными в прекращении передачи инфекции в другие города Китая. Рид и его коллеги пишут, что при эффективном сокращении поездок на 99%, уже к 4 февраля масштабы распространения эпидемии за пределами Уханя могут быть уменьшены только на 24,9%.


Скриншот диаграммы из статьи Джонатана Рида

Влияние введения ограничений на поездки из / в Ухань 23 января 2020 года на количество инфекций в других городах Китая

Предсказание Рида согласуется с другими модельными исследованиями ограничений на поездки, которые показывают, что сокращение поездок только задерживает распространение эпидемии в других городах, а не полностью подавляет распространение. Также, важно отметить, что модель Рида учитывала только воздушные перевозки и не учитывала потенциальное влияние ограничений на поездки, связанных с наземными перевозками.

Немного успокаивает тот факт, что Рид признает, что существует вероятность того, что он ошибается, в основном из-за использования ошибочных вводных:


Даже если предположить, что большинство предположений Рида чересчур суровы и пессимистичны, выводы, которые он делает в своей статье оставляют очень мало надежды на то, что эпидемия коронавируса будет сдержана в ближайшее время:

Наконец, в то время как Рид не делает никаких наблюдений о потенциальной смертности, связанной с nCoV, можно сделать широкое наблюдение: в субботу власти провинции Хубэй в Китае, столицей которой является город Ухань сообщила о 15 дополнительных случаях смерти от коронавируса, что добавило еще пятнадцать человек к ранее заявленным 26 жертвам, в результате чего общее число достигло 41. И если соотнести это с 1100 подтвержденных случаев заражения на тот же период – это означает, что уровень смертности от 2019-nCoV вырос примерно 2,5% до 4%. Это означает, что если выводы, сделанные Ридом верны, и если только в Хубее к 4 февраля будет заражено 250 000 человек, то не менее 10 000 китайцев погибнут в течение ближайших 2-3 недель.

Нетрудно предположить, что начало массовой эпидемии в России и других странах бывшего СССР, в таких условиях – это только вопрос времени. Но, по крайней мере, в отличие от Китая, у властей России есть время на подготовку для того, чтобы встретить эпидемию 2019-nCoV во всеоружии. Но, что-то подсказывает нам, что ничего сделано не будет. Поэтому, мы настоятельно советуем людям уже начинать готовиться к её приходу, потому что, как показывает опыт того же Китая те же медицинские маски, антисептики и прочее, а также продукты питания первой необходимости – это первое, что люди сметают с полок аптек и магазинов в случае возникновения чрезвычайной ситуации. Лучше быть готовыми сегодня, а потом посмеяться над своими страхами, чем быть не готовым совсем.

PS

По данным CNN по состоянию на вечер, 25 января, в 13 странах за пределами материкового Китая зарегистрировано 38 подтвержденных случаев заболевания коронавирусом из Уханя.

  • Австралия – 4
  • Франция – 3
  • Гонконг – 5
  • Таиланд – 5
  • Сингапур – 3
  • США – 2
  • Тайвань – 3
  • Макао – 2
  • Малайзия – 3
  • Непал – 1
  • Япония – 3
  • Вьетнам – 2
  • Южная Корея – 2


Грипп и новый коронавирус сильно отличаются друг от друга как по своему строению, так и по характеристикам

Патоген – любой фактор окружающей среды, способный вызвать повреждение систем организма или развитие заболеваний.

Как определить способность вирусов к распространению?

Чтобы разобраться в том, почему грипп и новый коронавирус – это разные вещи, следует начать с того, что представляет из себя вирус. Говоря простыми словами, вирус – это информационная система, зашифрованная в ДНК или РНК, окруженная защитной оболочкой. Защитная оболочка состоит из белка и помогает вирусам выживать и размножаться, позволяя “путешествовать” из одной клетки в другую. Можно даже сказать, что в некотором смысле вирусы – это паразиты, так как для того чтобы выжить им нужен живой организм – будь то амеба или человек.

Однако вирусы сильно отличаются друг от друга, а их наиболее важной характеристикой является способность к размножению или заразность. Чтобы определить насколько заразен тот или иной патоген, ученые используют базовое репродуктивное число R0, где R0 означает количество человек, которых может заразить один инфицированный. Так, в 2003 году в начале эпидемии SARS – тяжелый острый респираторный синдром – значение R0 было больше трех, однако уже через год снизилось до 0,3 и эпидемия сошла на нет. Что касается других вирусов, то у гепатита-С R0 равен 2, у ВИЧ инфекции R0 = 4, у кори R0 = 18, а у свинки R0 = 10. Иными словами, чем больше показатель R0, тем более заразен вирус. У каронавируса R0 = 3,5, что означает что один заболевший в среднем заражает более трех человек.

Насколько заразен сезонный грипп?

В 1918 году вирус гриппа H1N1 стал причиной самой страшной пандемии в истории. Более известный как “испанка”, он унес жизни 50 миллионов человек. Высокая патогенность испанки и исключительные обстоятельства ее распространения – о чем мы подробно рассказывали в нашем специальном материале – изменили мир. Сегодня новые штаммы гриппа появляются каждый год, а учитывая склонность этого вируса к мутациям, лучшее, что мы можем сделать – регулярно проходить вакцинацию. И да – прививки это хорошо, а с аргументами за и против можно ознакомиться здесь.


Переполненные больницы во время пандемии испанского гриппа, 1918 год

Однако даже несмотря на наличие вакцины, грипп продолжает уносить множество жизней. Согласно данным Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), осенью и зимой в Северном полушарии вирус гриппа ежегодно поражает от 5 до 15% населения. Грипп – заразное инфекционное заболевание, которое передается воздушно-капельным или контактным путем – через руки или предметы. Специалисты характеризуют способность гриппа к распространению как высокую, а базовое репродуктивное число сезонного гриппа равняется R0 = 1,3.

Почему CoVID-19 – это не грипп и чем они отличаются?

Итак, учитывая тот факт, что сезонный грипп довольно заразен, можно подумать, что его справедливо сравнивают с CoVID-19. Вот только все дело в том, что данных по новому коронавирусу у ученых сегодня намного меньше, чем по гриппу. CoVID-19 появился в конце 2019 года и чрезвычайно быстро преодолел два основных барьера – передачу от животного к человеку (как это сделали свиной и птичий грипп), и последующую передачу от человека к человеку. А с гриппом человечество имеет дело уже очень давно – на одном только сайте ВОЗ информации о нем так много, что можно зачитаться. К тому же, это первая в истории пандемия коронавируса.

Напомним, что коронавирус – это семейство вирусов, разделенное на два подсемейства. На январь 2020 года выявлено 40 видов коронавирусов, включая CoVID-19.


Не стоит недооценивать опасность нового коронавируса

Еще одним немаловажным отличием гриппа от коронавируса является тот факт, что у большинства населения с течением времени выработался иммунитет к вирусу гриппа. К тому же, после перенесенного гриппа у нас вырабатывается пожизненный иммунитет – причем как к перенесенному штамму, так и ко всем его близким “родственникам”. А вот в случае со вспышкой SARS-CoV-2 в 2003 году все было иначе. Так как это новая болезнь, у нас попросту не выработался к ней иммунитет. Как и к CoVID-19.

Насколько заразен CoVID-19?

По оценкам ряда специалистов, новый коронавирус может инфицировать до 70% населения Земли. Однако важно понимать, что CoVID-19 не носит сезонный характер – по крайней мере пока – а значит заражены могут быть 70% жителей планеты в целом. Опять-таки, нельзя с уверенностью прогнозировать тот или или иной вариант развития событий, так как пандемия только набирает обороты. Еще одним тревожным фактором является отсутствие стойкого иммунитета у излечившихся от коронавируса – после перенесенной инфекции риск заразиться тем же штаммом через несколько месяцев сохраняется. А теперь давайте посмотрим на цифры – согласно текущим оценкам ВОЗ, базовое репродуктивное число нового коронавируса равняется R0 = 2,4–4,5, что означает что один заразившийся может заразить в среднем еще 4 человека. Учитывая уровень смертности примерно 3% (тогда как у гриппа в 30 раз ниже, примерно 0,1%) — выглядит немного пугающе, правда? Ведь есть разница одна смерть на 1 000 человек или 3 на 100?

Еще больше статей о новом коронавирусе и других не менее опасных вирусах читайте на нашем канале в Яндекс.Дзен


Как вы думаете, что изображено на этой фотографии – коронавирус или вирус сезонного гриппа? Поделитесь ответом в комментариях к этой статье

Еще более тревожными выглядят данные по инкубационному периоду нового коронавируса – согласно имеющейся информации, симптомы CoVID-19 могут проявиться спустя от 5 до 24 дней. В Китае были выявлены случаи, когда инкубационный период составлял 27 дней. Сравните это с сезонным гриппом и его инкубационным периодом от 1 до 4 дней. При этом, инфицированный новым коронавирусом человек представляет опасность для окружающих во время всего инкубационного периода. Согласитесь, вирус H1N1 и CoVID-19 сильно отличаются друг от друга.

Изменилось ли ваше мнение о CoVID-19 после прочтения этой статьи? Поделитесь своим мнением в комментариях и с участниками нашего Telegram-чата

Комментарии редакции Hi-News.ru

«Наверное, я ближе всех из нашей редакции ощутил на себе реальность происходящего в мире. Мой ребенок ходит в школу в Европе, и в младшем классе у мальчика из соседнего класса выявили CoVID-19. Это было еще до всеобщего карантина: школу быстро закрыли (быстро — это 1 день), мы приняли решение не выходить на улицу, не ходить без масок и не трогать руками кнопки лифта, перила, ручки дверей. Отсидимся дома 2 недели, так как не хочется заразить соседей или других людей, если вдруг из школы вирус попал к нам. Машину, на которой забирали ребенка из школы ребенка и одежду, в которой он был в школе, не трогаем 3 дня. Пусть вирус если он есть перестанет быть опасным.

Еду заказывваем домой, просим оставить курьера все в коридоре, потом забираем. Упаоковки от еды снимаем в перчатках и выкидываем.

Мы находимся в разгаре эпидемии новой опасной инфекции, но достоверной информации о ней мало. В этой ситуации помогает молекулярная эпидемиология. Ход накопления мутаций эволюционирующим вирусом позволяет оценить важные параметры эпидемии даже при неточных официальных данных. Ситуация очень быстро меняется; все оценки, приведенные ниже, верны по состоянию на 9 февраля.


Рис. 1. Эволюционное древо коронавирусов (из работы [4]). Числа около ветвей обозначают их статистическую достоверность по шкале от 0 до 100. Красным выделены штаммы уханьской вспышки (Wuhan), а также ближайший к ним штамм, выделенный из летучей мыши (Bat CoV RaTG13)

На рис. 1 показано эволюционное дерево коронавирусов. Как и на обычных эволюционных деревьях, расстояние между любыми двумя ветвями здесь соответствует времени, прошедшему с момента расхождения двух линий от их общего предка (LCA — last common ancestor). Видно, что ближайший родственник группы вирусных штаммов, давших начало этой вспышке, — это коронавирус, выделенный из летучей мыши; между ним и эпидемическими штаммами совпадает около 96% нуклеотидов. Такая картина может означать, что вирус был передан от летучих мышей, хотя окончательные выводы о пути передачи делать рано; в случае SARS, чтобы разобраться, потребовались годы. (Сведения о еще более близких штаммах из панголина пока есть только в виде пресс-релиза [2]). В любом случае все имеющиеся данные свидетельствуют о том, что инфекция была получена из природного резервуара. Чуть дальше расположены штаммы SARS, с которыми совпадает

80% нуклеотидов; а еще дальше — штаммы MERS, ближневосточного респираторного синдрома [3, 4]. В последовательностях nCoV нет никаких свидетельств искусственной рекомбинации, вставок необычных фрагментов или какого-либо вмешательства; все сообщения об обратном, появлявшиеся в последние дни на препринтных серверах, были отозваны и/или опровергнуты.

Все линии nCoV более близки друг к другу, чем к любой другой известной вирусной последовательности. Это, по-видимому, означает, что занос был единственным. Не всегда бывает так: например, вспышки MERS в разные годы вызывались новыми переносами из природного резервуара — верблюдов [5].

Зная скорость эволюции (см. ниже), можно датировать LCA. По-видимому, он существовал в конце ноября — начала декабря. LCA мог быть у единственного человека, который заразил потом других, или же у животного, от которого заразилось несколько человек — это установить трудно. Первые описанные случаи датируются началом декабря; это означает, что вспышка была обнаружена почти сразу. Образцы вируса, выделенные с рынка в Ухане, очень близки к таковым у самых ранних пациентов из Уханя; это подтверждает, что первые люди заразились именно там.

Неизвестно, как мутации, отличающие nCoV от штаммов, распространенных у животных, изменили его характеристики и изменили ли вообще. Возможно, перескок был несчастной случайностью, не сопровождавшейся никакими изменениями генетических характеристик вируса по сравнению с его предками у диких животных.


Рис. 2. Эволюционное древо nCoV [7] (слева) и расстояние между образцом и корнем дерева в зависимости от даты получения образца

Во-вторых, можно проследить пути передачи. Первые надежные данные о передаче от человека человеку были получены именно таким образом. Можно задавать и более тонкие вопросы. Сколько людей заражается от членов семьи, сколько на работе, сколько в транспорте, сколько в больнице? Насколько эффективны карантинные меры? Как именно вирус переносится между странами? Можно пытаться узнать это по молекулярным данным. Это очень помогает с другими инфекциями, для которых таких данных больше, например с ВИЧ [10].

В-третьих, можно оценить скорость распространения вируса, а именно ставший знаменитым в последние дни показатель R0. R0, или базовое репродуктивное число, — это число людей, зараженных одним инфицированным за всё время течения болезни в полностью уязвимой популяции. Очевидно, что это ключевой показатель: если R0 меньше единицы, то эпидемия пойдет на спад, а если больше — то будет расти. Разные заболевания характеризуются очень разными значениями R0 — от 1,3 для гриппа до >10 для кори. Для ближайшего родственника nCoV — SARS — R0 составлял около 3 в начале вспышки и около 0,3 в ее конце [11].

Применение такого анализа к nCoV дает оценки R0 в районе 2 или 3 [7, 8]). Конечно, здесь тоже много предположений, многие из которых заведомо неверны: например, что выборка анализируемых последовательностей более-менее случайна и что на вирус не действует отбор. Но данные, полученные с использованием разных методов, взаимно подтверждают друг друга и позволяют сказать, что R0, по-видимому, находится где-то в диапазоне от 2,2 до 3,3 [12].

В последние дни появились работы, в которых моделируется развитие эпидемии при различных параметрах [13, 14, 15]. Важно понимать, что эти модели — не прогнозы. Во-первых, точность, с которой оценен R0, совершенно недостаточна. При R0

3 в отсутствие каких-либо мер и без предсуществующего иммунитета вспышка, например, в десятимиллионном городе будет быстрой и острой, будет иметь пик через два-три месяца, и на пике будут одновременно инфицированы десятки процентов населения [15]. Если же R0 ниже двух, то пик растянется на много месяцев и будет смазан (рис. 3).


Рис. 3. Число инфицированных в простейшей детерминистической SIR-модели [16]. Параметры: N=10 7 , γ=0,119

Во-вторых, практически невозможно моделировать такие факторы, как разработка вакцин, эффективность имеющихся лекарственных препаратов (которая остается пока практически неизвестной), а также принимаемые меры по снижению скорости распространения.

В-третьих, сам по себе R0 мало что говорит о том, насколько серьезной окажется эпидемия: R0 для риновирусов, вызывающих обыкновенную простуду, составляет

6, однако они не являются столь существенной проблемой мирового здравоохранения. Ключевые параметры, остающиеся неизвестными, — это доля тяжелых и смертельных случаев. Составит ли она

0,1% от общего числа инфицированных, как для ежегодного сезонного гриппа, 2,5%, как для испанки, или 10%, как для SARS? Эти сценарии будут очень разными. Имеющиеся сегодня данные не позволяют сказать, какой из них сбудется.

Георгий Базыкин
(Сколтех, ИППИ РАН)

  1. Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome. (2020).
  2. Cyranoski D. Did pangolins spread the China coronavirus to people? Nature (2020) doi: 10.1038/d41586-020-00364-2.
  3. Lu R. et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet 10 (2020).
  4. Zhou P. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 1–4 (2020) doi: 10.1038/s41586-020-2012-7.
  5. Zhang Z., Shen L. & Gu X. Evolutionary Dynamics of MERS-CoV: Potential Recombination, Positive Selection and Transmission. Sci Rep 6, (2016).
  6. Coronavirus 2019-nCoV global cases by Johns Hopkins CSSE.
  7. Rambaut A. Phylodynamic Analysis | 67 genomes | 08 Feb 2020. Virological (2020).
  8. Bedford T. Nextstrain / narratives / ncov / sit-rep / 2020-01-30 (2020).
  9. Peck K. M. & Lauring, A. S. Complexities of Viral Mutation Rates. Journal of Virology 92, (2018).
  10. Poon A. F. Y. et al. Near real-time monitoring of HIV transmission hotspots from routine HIV genotyping: an implementation case study. Lancet HIV 3, e231-238 (2016).
  11. World Health Organization. Consensus document on the epidemiology of severe acute respiratory syndrome (SARS). (2003).
  12. ncov-R0. Google Docs.
  13. Read J. M., Bridgen J. R., Cummings D. A., Ho A. & Jewell C. P. Novel coronavirus 2019-nCoV: early estimation of epidemiological parameters and epidemic predictions. medRxiv 2020.01.23.20018549 (2020) doi: 10.1101/2020.01.23.20018549.
  14. Riou J. & Althaus C. L. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019-nCoV. bioRxiv 2020.01.23.917351 (2020) doi: 10.1101/2020.01.23.917351.
  15. Wu J. T., Leung K. & Leung, G. M. Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study. The Lancet (2020) doi: 10.1016/S0140-6736(20)30260-9.
  16. Compartmental models in epidemiology. Wikipedia (2020).

Если вы нашли ошибку, пожалуйста, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter.

Читайте также:

Пожалуйста, не занимайтесь самолечением!
При симпотмах заболевания - обратитесь к врачу.